Đoàn Trường Đại học Hoa Sen là tổ chức Đoàn cơ sở trực thuộc Thành Đoàn TP. Hồ Chí Minh, được thành lập vào ngày 16/11/1999. Ngày 19/08/2007, Ban Chấp hành Đoàn trường lần IV nhiệm kỳ (2007 – 2009) đã chính thức ra mắt, đánh dấu 4 nhiệm kỳ phát triển không ngừng của Đoàn trường.
Hội sinh viên trường ĐHHS luôn phát huy truyền thống là nhịp cầu gắn bó giữa sinh viên với Đảng, Nhà nước với Đoàn thanh niên.
